Bei der Eingestuhlbehandlung wird der Bauch und der Rücken eines Patienten vollständig mit Eigenstuhl eingeschmiert. Dies geschieht mit Stuhl des Patienten, wobei der Stuhl für diese Anwendung besonders aufbereitet wird.
Die aufgetragene Schicht hat etwa eine Dicke von 5 cm. Sie muss durch Tücher feucht aber nicht nass gehalten werden. Nach etwa einer Stunde wird die Schicht aus Eigenstuhl wird entfernt.
Für eine nachhaltige Verbesserung des Zustands eines Patienten muss die Eigenstuhlbehandlung etwa vier bis sechs Mal im Abstand von jeweils einer Woche durchgeführt werden. Nach einem Jahr sollte die Therapie wiederholt werden.
Die Ideen der Behandlung gehen zurück auf Dr. med. Nobis und Dr. rer. nat. Börges. Beide haben in den Jahren 1999 bis 2001 diese Methode einschließlich der notwendigen Verfahren und Geräte zur Aufbereitung des Stuhls entwickelt. Dabei kamen ihnen ihr fachübergreifendes und gesamtheitliches Wissen zu Gute.